Управление исполнения наказаний Минюста РФ по Читинской области, как самостоятельная структура, было образовано приказом ГУИН МВД России от 16 февраля 1996 года №18. Читинский УИН стал правопреемником Службы исправительных дел и социальной реабилитации и предшествующих ей советских пенитенциарных органов, которые в 1922 году пришли на смену тюремной инспекции Забайкальской области, образованной в 1911 году.