1991-1992 гг. - главный специалист дирекции Постоянного комитета Правления Научно-Промышленного союза СССР по вопросам экономической реформы, г. Москва. 1992-1994 гг. - главный специалист, консультант дирекции Российского союза промышленников и предпринимателей по вопросам экономической политики. 1994-1994 гг. - советник Экспертного института Российского союза промышленников и предпринимателей. 1994-1995 гг. - заместитель руководителя Департамента экономической реформы - начальник управления государственного регулирования экономики Министерства экономики Российской Федерации. 1995-1996 гг. - заместитель начальника Департамента экономической реформы Министерства экономики Российской Федерации. 1996-1997 гг. - начальник Департамента экономической реформы Министерства экономики Российской Федерации, член коллегии Минэкономики России. 1997-1998 гг. - заместитель Министра экономики Российской Федерации. 1998-1999 гг. - заместитель Председателя правления АК "Промторгбанк". 1999-1999 гг. - исполнительный директор Евроазиатской рейтинговой службы. 1999-2000 гг. - вице-президент Фонда "Центр стратегических разработок". 2000-2003 гг. - Первый заместитель Министра экономического развития и торговли Российской Федерации. 2003-2005 гг. - Президент Фонда "Центр стратегических разработок". 2005-2007 гг. - руководитель Экспертного совета Организационного комитета по подготовке и обеспечению председательства Российской Федерации в "Группе восьми" в 2006 году, руководитель исследовательской группы Центра стратегических разработок, руководитель Экспертного совета при Совете по реализации приоритетных национальных проектов и демографической политике при Президенте Российской Федерации. С 24 сентября 2007 г. - Министр экономического развития и торговли Российской Федерации.
Юрист и один из самых популярных блогеров России Алексей Навальный известен расследованием коррупционных скандалов в российских корпорациях и защитой прав миноритарных акционеров.
Ведет активную деятельность против нарушений в сфере корпоративного управления. Защищает права акционеров таких крупных российских компаний как «Газпром», ОАО «Банк ВТБ», Сбербанк, «Роснефть», «Транснефть», «Сургутнефтегаз» и др.
Во время обучения в Финансовой академии, в 2000 году Алексей Навальный вступил в Российскую объединенную демократическую партию «Яблоко», в которой проработал до 2007 года.
В качестве юриста принимал участие в выборных кампаниях, в 2002 году был избран в региональный совет Московского отделения партии «ЯБЛОКО», в 2003 году в Москве руководил избирательной кампанией РОДП «Яблоко» на выборах в Госдуму.
В апреле 2004 стал руководителем аппарата Московского регионального отделения «Яблока», ходил в федеральный совет партии. В декабре 2007 года был исключен из партии.
В 2004 году основал «Комитет защиты москвичей» - общегородское движение, которое выступало против нарушения гражданских прав при реализации крупных проектов строительства в городе Москве.
В 2005 году стал одним из организаторов проекта альтернативных дебатов «Политические дебаты», в рамках которого организовывались встречи между политиками и общественными деятелями.
В 2009 году занимал пост советника губернатора Кировской области Никиты Белых, летом этого же года возглавил Фонд поддержки инициатив губернатора Кировской области.
В декабре 2009 года Алексей Навальный вместе с российской версией журнала Forbes создает проект по защите прав миноритарных акционеров.
В декабре 2010 года - запустил новый интернет-проект, содержащий информацию о "сомнительных" конкурсах госзакупок- РосПил.