После окончания института работал в Институте океанологии РАН им. П.П. Ширшова.

В 1989 году - создал компанию "ЛЭК" (Лаборатория экологического контроля). Компания занималась научно-производственной деятельностью и производила экологические приборы. В 1992 году "ЛЭК" поменяла основное направление деятельности и начала заниматься недвижимостью: сначала сдавала помещения в аренду, а после 1998 года, занялась строительством жилья.

В 1998 году Андрей Рогачев вместе с партнерами Александром Гидрой, Татьяной Франкус и Игорем Видяевым основал компанию "Агроторг", в 1999 году открыл первый магазин "Пятерочка" в Санкт-Петербурге.

В 2001 году - участвует в создании группы "Макромир"- девелопера коммерческой недвижимости. Компания занималась строительством и сдачей в аренду торгово-развлекательных комплексов.

В 2006 году - путем слияния компаний "Пятерочка" и "Перекресток" была создана X5 Retail Group, в которой Андрею Рогачеву принадлежало около 11,14% акций.

С мая 2006 по апрель 2008 года - член Наблюдательного Совета компании X5 Retail Group N.V. В 2008 году Андрей Рогачев продает X5 Retail Group акции сети гипермаркетов "Карусель", основанной им в 2004 году и выходит из состава Наблюдательного Совета X5 Retail Group. А в 2010 году, продав свой пакет акций, выходит из состава акционеров Х5 Retail Group.

В 2008 году - создал инвестиционно-банковскую группу Terra On, в которую вложил примерно $1 млрд. В этом же году регистрирует на свое имя товарный знак "ЛЭК. Строительная компания №1".

В апреле 2009 года - ООО "Макромир" подает иск о банкротстве компании, а в марте 2011 года Андрей Рогачев продает ее Fort Group, которая получила все шесть торговых комплексов "Макромира", в том числе "Французский бульвар", "Фиолент", "Феличита", "Сити Молл" и "замороженный" торговый центр "Долгоозерный", а также все ее долги и требования.

Несколько лет предприниматель провел в Америке, где даже запускал проект в рознице Okey-Dokey Grocery Markets в Майами.

Однако в 2012 году он окончательно вернулся в Россию и сосредоточился на своем новом проекте - сети универсамов "Верный". За три неполных года количество магазинов сети превысило 430 объектов.

В 2015 году - открыл в Москве новую сеть в формате магазинов фиксированных цен под брендом Fan Price.

Участник "Рейтинга миллиардеров ДП - 2024"

Занимал 20 место в "Рейтинге миллиардеров ДП - 2016". Состояние оценивалось в 45 млрд рублей. Основные активы: Сеть "Верный", рынки в Москве, деньги от продажи доли в Х5 Retail Group.

Занимал 11 место в "Рейтинге миллиардеров ДП - 2017". Состояние оценивалось в 77,9 млрд рублей. Основные активы: Сеть "Верный", четыре сельскохозяйственных рынка в Москве и земельные участки в Петербурге, Х5 Retail Group.

Занимал 25 место в "Рейтинге миллиардеров ДП - 2018". Состояние оценивалось в 42 млрд рублей. Основные активы: Сеть "Верный", четыре сельскохозяйственных рынка в Москве и земельные участки в Петербурге, веб-платформа "Агро24".

Занимал 16 место в "Рейтинге миллиардеров ДП - 2019". Состояние оценивалось в 54 млрд рублей. Основные активы: Сеть "Верный", веб-платформа "Агро24", с/х рынки.

Занимал 19 место в "Рейтинге миллиардеров ДП - 2020". Состояние оценивалось в 48,7 млрд рублей. Основные активы: Сеть "Верный", веб-платформа "Агро24".

Занимал 46 место в "Рейтинге миллиардеров ДП - 2021". Состояние оценивалось в 20,51 млрд рублей. Основные активы: Союз Св. Иоанна Воина.

Занимал 98 место в "Рейтинге миллиардеров ДП - 2022". Состояние оценивалось в 8,04 млрд рублей. Основные активы: Союз Св. Иоанна Воина.

Занимал 72 место в "Рейтинге миллиардеров ДП - 2023". Состояние оценивалось в 10,94 млрд рублей. Основные активы: Союз Св. Иоанна Воина.

В 1986 году - окончил Ленинградский метеорологический институт.